Związki o podobnej budowie do substratów
Związki te dzięki podobieństwu w budowie, zajmują miejsce substratu w centrum aktywnym. Wówczas enzym nie może przyłączyć substratu i katalizować reakcji.
Jony metali ciężkich
Jony metali ciężkich wiążą się łatwo i w sposób nieodwracalny ze wszystkimi białkami. Prowadzi to do zmiany kształtu białek – powodując ich denaturację.
Należą do nich, m.in. jony rtęci, srebra, miedzi, ołowiu.
Niektóre metabolity (produkty reakcji enzymatycznych)
W sposób odwracalny obniżają aktywność enzymu. Hamowaniem aktywności enzymu przez produkty katalizowanych przez nie reakcji nazywa się ujemnym sprzężeniem zwrotnym. Ujemne sprzężenie zwrotne jest jednym z głównych mechanizmów szlaków metabolicznych.